MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002944	CG	3	6	203421	203426	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5002	NC_002944	CGGG	2	8	203434	203441	0 %	0 %	75 %	25 %	41406296
5003	NC_002944	G	6	6	203439	203444	0 %	0 %	100 %	0 %	41406296
5004	NC_002944	CG	3	6	203470	203475	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5005	NC_002944	GCC	2	6	203522	203527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5006	NC_002944	CGC	2	6	203543	203548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5007	NC_002944	CAG	2	6	203554	203559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5008	NC_002944	TCG	2	6	203618	203623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5009	NC_002944	GGC	2	6	203722	203727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5010	NC_002944	GC	3	6	203726	203731	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5011	NC_002944	GCCG	2	8	203733	203740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5012	NC_002944	CGG	2	6	203745	203750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5013	NC_002944	TGG	2	6	203778	203783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406296
5014	NC_002944	GCA	2	6	203799	203804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5015	NC_002944	GC	3	6	203823	203828	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5016	NC_002944	CCCGCG	2	12	203841	203852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5017	NC_002944	GAT	2	6	203860	203865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406296
5018	NC_002944	GGCCG	2	10	203908	203917	0 %	0 %	60 %	40 %	41406296
5019	NC_002944	CGG	2	6	203918	203923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5020	NC_002944	GCGG	2	8	203926	203933	0 %	0 %	75 %	25 %	41406296
5021	NC_002944	CAG	2	6	203987	203992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5022	NC_002944	CCG	2	6	203994	203999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5023	NC_002944	CCG	2	6	204039	204044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5024	NC_002944	CGG	2	6	204124	204129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5025	NC_002944	GCACCG	2	12	204273	204284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	41406297
5026	NC_002944	CGGC	2	8	204293	204300	0 %	0 %	50 %	50 %	41406297
5027	NC_002944	AGG	2	6	204308	204313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406297
5028	NC_002944	CGA	2	6	204318	204323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5029	NC_002944	GCT	2	6	204324	204329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5030	NC_002944	GTG	2	6	204553	204558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406297
5031	NC_002944	TGC	2	6	204569	204574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5032	NC_002944	TGC	2	6	204629	204634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5033	NC_002944	CGT	2	6	204671	204676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5034	NC_002944	CTG	2	6	204688	204693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5035	NC_002944	GCCGG	2	10	204735	204744	0 %	0 %	60 %	40 %	41406297
5036	NC_002944	GGC	2	6	204747	204752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406297
5037	NC_002944	CGGC	2	8	204789	204796	0 %	0 %	50 %	50 %	41406297
5038	NC_002944	TCG	2	6	204875	204880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5039	NC_002944	GCGAAC	2	12	204892	204903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5040	NC_002944	CGG	2	6	204958	204963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406298
5041	NC_002944	GCA	3	9	204989	204997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5042	NC_002944	CTGG	2	8	205020	205027	0 %	25 %	50 %	25 %	41406298
5043	NC_002944	GGC	2	6	205035	205040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406298
5044	NC_002944	CTG	2	6	205122	205127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5045	NC_002944	CGA	2	6	205175	205180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5046	NC_002944	GTA	2	6	205182	205187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406298
5047	NC_002944	CCG	2	6	205216	205221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406298
5048	NC_002944	GCGGG	2	10	205222	205231	0 %	0 %	80 %	20 %	41406298
5049	NC_002944	CGA	2	6	205253	205258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5050	NC_002944	GC	3	6	205401	205406	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5051	NC_002944	AGCG	2	8	205407	205414	25 %	0 %	50 %	25 %	41406299
5052	NC_002944	GGA	2	6	205469	205474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406299
5053	NC_002944	CGC	2	6	205493	205498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406299
5054	NC_002944	CTG	2	6	205554	205559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406299
5055	NC_002944	CGCC	2	8	205604	205611	0 %	0 %	25 %	75 %	41406299
5056	NC_002944	CGA	2	6	205616	205621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406299
5057	NC_002944	ATC	2	6	205626	205631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406299
5058	NC_002944	GCC	2	6	205644	205649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406299
5059	NC_002944	TCT	2	6	205651	205656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406299
5060	NC_002944	ACG	2	6	205666	205671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406299
5061	NC_002944	CGC	2	6	205691	205696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406299
5062	NC_002944	GAG	2	6	205707	205712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406299
5063	NC_002944	GCG	2	6	205776	205781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406299
5064	NC_002944	CGGCGC	2	12	205802	205813	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5065	NC_002944	GC	3	6	205835	205840	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5066	NC_002944	CG	3	6	205850	205855	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5067	NC_002944	CGA	2	6	205904	205909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406299
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5069	NC_002944	GC	3	6	205961	205966	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5070	NC_002944	CACCGC	2	12	205988	205999	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	41406299
5071	NC_002944	ATGA	2	8	206067	206074	50 %	25 %	25 %	0 %	41406300
5072	NC_002944	ACG	2	6	206077	206082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406300
5073	NC_002944	CCG	2	6	206116	206121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406300
5074	NC_002944	TGC	3	9	206125	206133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406300
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5077	NC_002944	CGA	2	6	206270	206275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406300
5078	NC_002944	CGA	2	6	206296	206301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406300
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5080	NC_002944	GGCC	2	8	206429	206436	0 %	0 %	50 %	50 %	41406300
5081	NC_002944	CG	3	6	206463	206468	0 %	0 %	50 %	50 %	41406300
5082	NC_002944	CGC	2	6	206491	206496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406300
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5086	NC_002944	CGGCC	2	10	206672	206681	0 %	0 %	40 %	60 %	41406300
5087	NC_002944	GAA	2	6	206747	206752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406300
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5090	NC_002944	TCG	2	6	206926	206931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406300
5091	NC_002944	GCT	2	6	206966	206971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406300
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5093	NC_002944	GC	3	6	207003	207008	0 %	0 %	50 %	50 %	41406300
5094	NC_002944	GC	3	6	207012	207017	0 %	0 %	50 %	50 %	41406300
5095	NC_002944	ACC	2	6	207022	207027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406300
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5099	NC_002944	GCA	3	9	207152	207160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406300
5100	NC_002944	CGGCG	2	10	207174	207183	0 %	0 %	60 %	40 %	41406300
5101	NC_002944	CCGAC	2	10	207193	207202	20 %	0 %	20 %	60 %	41406300
5102	NC_002944	CGT	2	6	207203	207208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406300
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5104	NC_002944	CAT	2	6	207386	207391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406300
5105	NC_002944	CAC	2	6	207398	207403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406300
5106	NC_002944	CGG	2	6	207443	207448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406300
5107	NC_002944	ACT	2	6	207451	207456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406300
5108	NC_002944	CTG	2	6	207465	207470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406300
5109	NC_002944	CG	3	6	207505	207510	0 %	0 %	50 %	50 %	41406300
5110	NC_002944	CCGATC	2	12	207525	207536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	41406300
5111	NC_002944	CGG	2	6	207569	207574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406300
5112	NC_002944	GGCA	2	8	207613	207620	25 %	0 %	50 %	25 %	41406300
5113	NC_002944	GACC	2	8	207623	207630	25 %	0 %	25 %	50 %	41406300
5114	NC_002944	CAG	2	6	207673	207678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406301
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5117	NC_002944	CGGC	2	8	207766	207773	0 %	0 %	50 %	50 %	41406301
5118	NC_002944	GCG	2	6	207793	207798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406301
5119	NC_002944	CGGCT	2	10	207847	207856	0 %	20 %	40 %	40 %	41406301
5120	NC_002944	GCG	2	6	207916	207921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406301
5121	NC_002944	CGC	2	6	207931	207936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406301
5122	NC_002944	CGT	3	9	207957	207965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406301
5123	NC_002944	CGT	2	6	208025	208030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5124	NC_002944	GCC	2	6	208034	208039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406302
5125	NC_002944	GCG	2	6	208122	208127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406302
5126	NC_002944	TTCG	2	8	208205	208212	0 %	50 %	25 %	25 %	41406302
5127	NC_002944	GAA	2	6	208227	208232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406302
5128	NC_002944	GCC	2	6	208254	208259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406302
5129	NC_002944	GCA	2	6	208325	208330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5130	NC_002944	TCG	2	6	208480	208485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5131	NC_002944	GC	3	6	208513	208518	0 %	0 %	50 %	50 %	41406302
5132	NC_002944	CAG	2	6	208527	208532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5133	NC_002944	GGC	2	6	208602	208607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406302
5134	NC_002944	CGG	2	6	208649	208654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406302
5135	NC_002944	GAT	2	6	208664	208669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406302
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5137	NC_002944	ATC	2	6	208717	208722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406302
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5139	NC_002944	GC	3	6	208747	208752	0 %	0 %	50 %	50 %	41406302
5140	NC_002944	GTC	2	6	208806	208811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
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5143	NC_002944	CAC	2	6	208863	208868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406302
5144	NC_002944	GGCG	2	8	208898	208905	0 %	0 %	75 %	25 %	41406302
5145	NC_002944	GCA	2	6	209003	209008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406302
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5147	NC_002944	CGT	2	6	209066	209071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5148	NC_002944	TGC	2	6	209090	209095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
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5151	NC_002944	GAT	2	6	209154	209159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406302
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5153	NC_002944	GAA	2	6	209208	209213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406302
5154	NC_002944	GCA	3	9	209270	209278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5155	NC_002944	TTG	2	6	209290	209295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406302
5156	NC_002944	TTC	2	6	209311	209316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406302
5157	NC_002944	TGT	2	6	209393	209398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406302
5158	NC_002944	CGGGAA	2	12	209400	209411	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	41406302
5159	NC_002944	TGC	2	6	209456	209461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406302
5160	NC_002944	GATCAC	2	12	209810	209821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	41406303
5161	NC_002944	GCG	2	6	209845	209850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406303
5162	NC_002944	AGG	2	6	209956	209961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406303
5163	NC_002944	CAT	2	6	209987	209992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406303
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5213	NC_002944	GCAT	2	8	211649	211656	25 %	25 %	25 %	25 %	41406305
5214	NC_002944	CCA	2	6	211664	211669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406305
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5228	NC_002944	CCCA	2	8	211984	211991	25 %	0 %	0 %	75 %	41406305
5229	NC_002944	GGA	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406305
5230	NC_002944	CCGG	2	8	212064	212071	0 %	0 %	50 %	50 %	41406305
5231	NC_002944	CGA	5	15	212173	212187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406306
5232	NC_002944	CCGCG	2	10	212218	212227	0 %	0 %	40 %	60 %	41406306
5233	NC_002944	CGG	2	6	212233	212238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406306
5234	NC_002944	CG	3	6	212239	212244	0 %	0 %	50 %	50 %	41406306
5235	NC_002944	GTG	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
5236	NC_002944	GCC	2	6	212262	212267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
5237	NC_002944	CGC	2	6	212268	212273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
5238	NC_002944	GGT	2	6	212287	212292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
5239	NC_002944	CCGC	2	8	212373	212380	0 %	0 %	25 %	75 %	41406306
5240	NC_002944	GGGGC	2	10	212438	212447	0 %	0 %	80 %	20 %	41406306
5241	NC_002944	CGC	2	6	212490	212495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
5242	NC_002944	TCA	2	6	212499	212504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406306
5243	NC_002944	ACA	2	6	212541	212546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406306
5244	NC_002944	TCGA	2	8	212555	212562	25 %	25 %	25 %	25 %	41406306
5245	NC_002944	GCT	2	6	212590	212595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406306
5246	NC_002944	GCCGG	2	10	212601	212610	0 %	0 %	60 %	40 %	41406306
5247	NC_002944	GC	3	6	212612	212617	0 %	0 %	50 %	50 %	41406306
5248	NC_002944	GCC	2	6	212630	212635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
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5357	NC_002944	GAC	3	9	217036	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406309
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5370	NC_002944	GC	4	8	217442	217449	0 %	0 %	50 %	50 %	41406310
5371	NC_002944	CCA	2	6	217453	217458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406310
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5373	NC_002944	GGT	2	6	217562	217567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
5374	NC_002944	GCC	2	6	217648	217653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
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5378	NC_002944	TCG	2	6	217684	217689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
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5384	NC_002944	TGG	2	6	217894	217899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
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5402	NC_002944	GAC	2	6	218541	218546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
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5419	NC_002944	TGC	2	6	219202	219207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
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5478	NC_002944	CGA	2	6	220845	220850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5479	NC_002944	TGC	2	6	220862	220867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
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5481	NC_002944	TGGG	2	8	220975	220982	0 %	25 %	75 %	0 %	41406313
5482	NC_002944	TGGCGC	3	18	221006	221023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406313
5483	NC_002944	GCT	2	6	221049	221054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5484	NC_002944	GCGCG	2	10	221063	221072	0 %	0 %	60 %	40 %	41406313
5485	NC_002944	GCC	2	6	221096	221101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5486	NC_002944	TGC	2	6	221111	221116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5487	NC_002944	CCG	2	6	221117	221122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5488	NC_002944	GCC	2	6	221145	221150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5489	NC_002944	TGG	2	6	221215	221220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406313
5490	NC_002944	ATG	2	6	221221	221226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406313
5491	NC_002944	CCGG	2	8	221253	221260	0 %	0 %	50 %	50 %	41406313
5492	NC_002944	CCG	2	6	221262	221267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5493	NC_002944	TCG	2	6	221291	221296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5494	NC_002944	GGGC	2	8	221337	221344	0 %	0 %	75 %	25 %	41406313
5495	NC_002944	ATG	2	6	221356	221361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406313
5496	NC_002944	GGC	2	6	221381	221386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
5497	NC_002944	TCG	2	6	221399	221404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5498	NC_002944	CCG	2	6	221405	221410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5499	NC_002944	CTA	2	6	221451	221456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406313
5500	NC_002944	CTG	2	6	221461	221466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313

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